Cual si fuera una corona hay cinco colores de marcado de la abeja reina que siguen una secuencia de colores  internacionalmente reconocida dependiendo del último número del año en que nació la reina. Como las reinas no viven más de 5 años, el código de color comienza de nuevo en el sexto año. Un mnemónico común utilizado por los apicultores para recordar los colores es: «¿Alzarás buenas abejas?». 

Los rotuladores de pintura de coches, de pintura POSCA o marcadores en base de Aceite pueden usarse para marcar a la reina. La marca identificativa debe ser pequeña, para que no cubra ninguna otra parte de la reina. Un palo de 1/16 «ligeramente sumergido en pintura» es un buen aplicador. En general, las reinas se marcan antes de ser introducidas, pero también pueden ser marcadas en cualquier momento. La pintura debe tener tiempo para secarse antes de que la reina sea liberada en la colonia. De hecho, las reinas pueden comprarse ya marcadas por el productor de reinas.